基因组目标区域重测序
使用Illumina Genome AnalyzerⅡ对基因组挑选某些特定区域进行测序。节约了测序成本和时间，有助于发现大量个体基因变异、靶向筛选核酸序列等。
染色质免疫共沉淀技术测序（chip-seq 组蛋白 转录因子）
将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术，能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。
高通量测序及生物信息学分析技术
提供高通量测序技术及生物信息学分析。包括微生物细菌、真菌全基因组测序、原核转录组测序、宏基因组测序、动植物全基因组测序、重测序、转录组测序、小RNA测序、Chip-seq测序等
土壤微生物多样性分析
基于16S/18S/ITS序列扩增，根据客户需求采用不同测序平台（Roche 454和 Illumina），利用NGS高通量测序技术，获得庞大的数据信息，通过现代生物信息学手段，获得微生物总体群落.
人类外显子组测序，80X，分析
全球前10大药业公司中有5家是药明康德基因组学中心的测序客户。用illumina（62M）或Nimblegen V3(64M)捕获试剂盒，再用Hiseq 2000进行测序，10G数据。含信息分析
真核mRNA测序
真核mRNA转录组测序是借助新一代高通量测序技术，以真核细胞在某一功能状态下所能转录出的全部mRNA为研究对象，全面了解该生物样品在特定时空下基因的表达情况。
基因组denovo测序
基因组denovo测序即从头测序，是不依赖于任何参考序列对某物种进行测序，通过生物信息学分析手段进行拼接、组装，从而获得该物种全基因序列图谱。一个物种基因组序列图谱的完成，将带动该物种一系列后续研究。