科研热点|4篇10分+文章来解析m6A高分文章怎么发？-技术前沿-资讯-生物在线

科研热点|4篇10分+文章来解析m6A高分文章怎么发？

作者：上海云序生物科技有限公司 2020-04-13T10:23 (访问量:4688)

云序生物自2016年开发m6A RNA甲基化测序技术平台后，至今m6A检测数量累计超过5000+，是国内发表10分以上文章最多的RNA甲基化测序平台。云序先后为上海交通大学、复旦大学、北京大学、浙江大学、同济大学等共计200+科研单位提供m6A测序，发表在Hepatology、Nucleic Acids Research、Molecular Cancer等期刊上，今天我们围绕云序客户这几篇高分文章一起来回顾一下m6A的研究策略。

案例1：SUMO化修饰调控m6A RNA甲基化酶METTL3 及其催化功能

论文题目：SUMOylation of the m6A-RNA methyltransferase METTL3 modulates its function

发表日期：2018.2.28

发表期刊：Nucleic Acids Research

影响因子：10.162

研究机构：上海交通大学医学院余健秀团队

云序提供：m6A-seq，RNA-seq

内容解析：

本文作者与他的研究团队鉴定了METTL3的SUMO化修饰及其调控功能。他们发现，在细胞中敲低SUMO特异性蛋白酶SENP1可明显降低细胞内RNA的m6A修饰水平。这一修饰并未影响该蛋白的稳定性及其在细胞中的定位，也未改变该蛋白和METTL14及WTAP之间的相互作用。通过体内及体外实验，他们发现METTL3的SUMO化修饰可明显抑制其m6A甲基化转移酶的活性、促进特异癌细胞的克隆形成及肿瘤生成。稳定敲除METTL3后，结合m6A-MeRIP-seq及RNA-seq手段发现，m6A RNA甲基化修饰图谱及下游mRNA表达图谱均发生明显改变。自此，METTL3借助SUMO化修饰调控下游mRNA m6A修饰及表达的论点完全成立。

案例2：甲基化酶METTL3介导的m6A修饰调控胃癌细胞EMT过程

论文题目：METTL3-mediated N6-methyladenosine modification is critical for epithelialmesenchymal transition and metastasis of gastric cancer

发表日期：2019.10.13

发表期刊：Molecular Cancer

影响因子：10.7

研究机构：上海仁济医院赵刚团队

云序提供：m6A-seq，RNA-seq

内容解析：

上皮间充质转换（EMT）过程是多种癌症细胞发生转移的重要特征，胃癌也不例外。发生EMT时，胃癌细胞逐步减少E-cadherin等细胞黏附蛋白的同时表达大量如N-cadherin、Vimentin等间充质标志蛋白。EMT和较差的临床预后紧密相关，所以理解EMT过程对于任何一种癌症的治疗都具有重要意义。之前的研究已经表明RNA甲基化修饰m6A在癌症发生发展中有调控作用，m6A甲基化酶（METTL3/METTL14/WTAP）、m6A去甲基化酶（FTO/ALKBH5）在多种疾病当中作用已经被证实，而本篇文章通过m6A-MeRIP-seq及RNA-seq手段发现METTL3是胃癌细胞EMT以及转移过程的重要促进因子，对胃癌细胞的转移具有重要调控作用。

案例3：甲基化酶METTL3介导的m6A mRNA甲基化调控CTNNB1促进肝母细胞瘤的增殖

论文题目：m6A mRNA methylation regulates CTNNB1 to promote the proliferation of hepatoblastoma

发表日期：2019.12.23

发表期刊：Molecular Cancer

影响因子：10.679

研究机构：上海第十人民医院孙奋勇团队&上海儿童医学中心

云序提供：m6A-seq、RNA-seq

内容解析：

本文作者通过对肝母细胞癌（HB）组织和癌旁组织进行m6A MeRIP-seq和RNA-seq，发现m6A主要富集在终止密码子和CDS区。KEGG预测分析发现，发生m6A修饰的mRNA主要富集在Wnt /β-catenin通路。而且，m6A修饰水平降低会导致CTNNB1表达和稳定性下降。本篇文章表明 mRNA发生m6A修饰是HB的一种致癌机制，并鉴定CTNNB1是HB中METTL3介导的m6A修饰的靶点基因。

案例4：m6A阅读器蛋白YTHDC2调节mRNA稳定性改善肝脏甘油三酯沉积

论文题目：N6-methyladenosine Reader Protein Ythdc2 Suppresses Liver Steatosis via Regulation of mRNA Stability of Lipogenic Genes

发表日期：2020.3.9

发表期刊：Hepatology

影响因子：14.97

研究机构：复旦大学附属中山医院&华东师范大学

云序提供：m6A-seq，RNA-seq，m6A-merip-PCR

内容解析：

在本研究中，作者发现m6A RNA修饰在肥胖相关NAFLD进展中的作用，通过m6A-merip-seq和RNA-seq，发现在瘦素受体缺陷型小鼠的肝脏组织中，甘油三酯合成相关基因的m6A修饰和mRNA表达均明显增加, 而m6A阅读器蛋白YTHDC2的表达明显下调。抑制正常小鼠肝脏中YTHDC2表达后，导致甘油三酯（TG）的沉积；而在肥胖小鼠肝脏中过表达YTHDC2基因后，则改善了肝脏甘油三酯沉积和胰岛素抵抗。因此，本研究表明以m6A为代表的RNA新型修饰，在NAFLD相关肝脏疾病中发挥重要作用，从而为这类疾病的研究提供了新的方向。

云序生物m6A全转录组测序介绍：

涵盖分子：同时检测circRNA、lncRNA、mRNA的m6A甲基化

实验原理：利用m6A特异性抗体，通过免疫共沉淀技术（MeRIP方法）特异性富集发生甲基化修饰的RNA，与不处理组（Input）做对比，对m6A修饰进行高通量测序和peak峰定位。

分析部分内容展示：

云序生物服务优势：

优势一：发表10分以上文章最多的m6A RNA甲基化测序服务平台。

优势二：全面检测mRNA和各类非编码RNA（circRNA，lncRNA, Pri-miRNA等）。

优势三：独家提供m6A一站式服务：m6A整体水平检测、m6A测序、MeRIP-qPCR验证、RIP和RNA pull-down等。

优势四：率先研发超微量MeRIP测序技术，RNA量低至500ng起。

优势五： RNA修饰测序平台，提供m6A、m5C、m1A、m7G、m3C、ac4C乙酰化和2'-O-甲基化测序。

云序生物RNA修饰测序：

云序疫情期间针对m6A以及其他各类RNA修饰的讲座视频已经全部录好，对RNA修饰感兴趣的老师可以点击以下链：

cloudseq.mikecrm.com/YJUc33n

上海云序生物科技有限公司
Shanghai Cloud-seq Biotech Co., Ltd.
地址：上海市松江区莘砖公路 518 号 20 号楼 3 楼
电话：021-64878766
传真：021-64878766
网址：www.cloud-seq.com.cn
邮箱：market@cloud-seq.com.cn

上海云序生物科技有限公司商家主页

地址：上海市松江区莘砖公路518号24号楼4楼

联系人：戴小姐

电话： 021-64878766

传真： 021-64878766

Email：market@cloud-seq.com.cn;liuqingqing@cloud-seq.com.cn